洁净手术部作为一项专业性强、要求高的系统项目，其项目设计开始之前就要和医院交流项目立项规模，净化科室规划，并要提出专业性的建设性建议，确立一级、二级流程的规划；将医院的意图转化为设计蓝图。

洁净手术部按科室可划分为净化科室和洁净科室，其中：

净化科室包含：静脉配液中心、生殖中心、层流病房、层流手术室、检验科微生物实验区、剖宫产房、介入手术室、复合手术室、供应室的无菌物品存放区等；

洁净科室包含：ICU PICU CCU EICU、病理科、供应室的去污区、检查包装及灭菌区、血液库房、检验科生化免疫区、分娩产科、DSA导管室等。

按专业可划分为完整科室区域、部分科室区域、工程专业三个类型，其中：

  完整科室区域又划分为办公区域、洁净区域、净化区域、污物区域；

  部分科室区域又划分为洁净区域、净化区域、污染区域；

  工程专业又划分为装饰、暖通、强弱电、给排水、医用气体。

洁净手术部的施工交叉面特别多，往往牵扯土建地面找平、砖砌体隔断、消防工程，同时系统验收除了与国家建筑行业验收规范相关外，也与装饰材料、净化通风行业的相关标准息息相关，若拆分专业，其管理职责难以区分，因此专业不可分割，另每个医院都有其特殊性，医院洁净手术部的科学、合理建设同医院相关科室的参与和决策密切相关，这就需要设计单位在系统规划之初时就要同医院相关负责人进行紧密、充分的沟通，以使建成后的洁净手术部符合医院当下和未来发展使用。